在新能源发电乙级资质申请过程中，如果出现异议或投诉，通常应按照以下步骤进行处理：

明确异议或投诉内容：首先，需要明确异议或投诉的具体内容和理由，包括涉及到的资质标准、人员资格、业绩证明或其他具体问题。

内部复核：企业在接到异议或投诉后，应先进行内部审查，核实相关信息的真实性和准确性。如果发现确实存在问题，应及时修正并向提出异议方反馈初步处理意见。

正式提交反馈：如果企业认为异议或投诉不成立，应准备详细的书面说明和相关证据，包括但不限于人员证书、项目合同、验收报告等，正式提交给负责资质审批的省级住建厅或相应的审批机构。

官方调查：省级住建厅或审批机构收到异议或投诉后，会组织专家或相关部门进行调查。这可能包括资料复核、现场核查或听取双方陈述等环节。

参与听证：在某些情况下，可能需要召开听证会，企业应准备好相关材料，并派遣代表参加，就异议或投诉事项进行答辩。

等待决定：审批机构根据调查结果作出决定，可能包括维持原审批结果、要求企业补充材料、整改或撤销资质等。此决定应书面通知企业及异议或投诉方。

申诉权利：如果企业对处理结果不满意，通常有权向上级主管部门或通过行政复议、诉讼等方式进一步申诉。

在整个处理过程中，重要的是保持沟通渠道畅通，遵循法定程序，确保处理过程公平、公正、透明。同时，企业也应以此为契机，审视自身资质申请和管理中的不足，不断改进和提升。
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